| Chemistry Development Kit
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| Basisdaten
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| Entwickler | Christoph Steinbeck, Egon Willighagen, Dan Gezelter |
| Aktuelle Version |
1.2.7 (12. September 2010) |
| Programmiersprache | Java |
| Kategorie | Chemoinformatik |
| Lizenz | GNU LGPL |
| deutschsprachig | nein |
| cdk.github.io | |
Das Chemistry Development Kit (CDK) ist eine freie Open-Source-Software-Bibliothek für Bio- und Chemoinformatik. Sie wurde erstmals am 11. Mai 2001 von Christoph Steinbeck, Egon Willighagen und Dan Gezelter vorgestellt. Das Projekt steht unter der Schirmherrschaft von Blue Obelisk.
Das CDK ist in Java geschrieben. Es bietet Funktionalitäten um eigene Chemie-Software zu schreiben. Damit können chemische Formeln eingegeben werden, molekulare Modellierung (2-D- und 3-D-Rendern) durchgeführt und quantitative Struktur-Wirkungs-Beziehungen dargestellt werden. Die Auszeichnungssprache Chemical Markup Language, MDL Molfile sowie die Simplified Molecular Input Line Entry Specification und International Chemical Identifiers werden unterstützt. Mit dem CDK können Algorithmen für chemische Graphentheorie geschrieben werden.
Die Bibliothek kann in Microsoft Excel (LICSS), die statistische Programmiersprache R, die Statistik-Software KNIME, Apache Taverna und Bioclipse eingebunden werden. Innerhalb von OpenChrom wird sie zur Darstellung von identifizierten Substanzen verwendet.
Literatur
- Christoph Steinbeck u. a.: The Chemistry Development Kit (CDK). an open-source Java library for Chemo- and Bioinformatics. In: Journal of chemical information and computer sciences. Band 43, Nr. 2. American Chemical Society, Washington D.C. 2003, S. 493–500, PMC 12653513 (freier Volltext).